Нейрофизиологические методы занимают особое место среди средств нейромониторинга. Оцениваемая ими функциональная активность мозга может рассматриваться как важнейшая цель интенсивной терапии. Электроэнцефалограмма представляет собой суммарную активность корковых нейронов. Анализ вызванных стволовых потенциалов отражает деятельность стволовых структур. Только под контролем электроэнцефалограммы возможно использование такого агрессивного способа лечения внутричерепной гипертензии, как барбитуровой комы. Основной проблемой получения информации с помощью нейрофизиологических методов является интерпретация полученных результатов. Попытки автоматического анализа, основанные на сжатии данных, приводят к серьезной потере информативности. Анализ нативного материала очень трудоемок и возможен только при помощи специалистов-нейрофизиологов. Преодоление этих недостатков является задачей будущего.